在施用上，要考慮到生物有機肥種類多、特點不一的特性，不僅相互間搭配還要與適量化肥搭配施用。

    首當其沖地要在經濟類作物中，充分開發和合理施用糞尿類生物有機肥源。由于糞尿類生物有機肥的主要特點是養分含量高于其它生物有機肥，但是其碳氮比（C/N）范圍比較窄，一般在6～10之間，為此，要添加部分粉碎的秸稈組成混合生物有機肥施用。

    這樣既可實現農村環境的清潔化又可保證果蔬類農產品的質量和**性。施用糞尿類生物有機肥可以部分地替代化學肥料對作物的氮磷養分供給，從而減少化肥的施用量，提高化肥利用率。